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Wenn man mal eine schnelle Lösung benötigt um zwei gleiche Ordner zu vergleichen. Bieten sich folgenden Windows Boardmittel an:
Als erstes muss man sich ein Übersicht erstellen lassen, was der derzeitige Ist Stand ist. Funktioniert mit folgenden Befehlen:

dir C:\Ordner1 /S /AD /B /ON>C:\AndereOrdner\Ordner1.txt
dir C:\Ordner2 /S /AD /B /ON>C:\AndereOrdner\Ordner2.txt

/S Listet Dateien und alle Unterverzeichnisse auf
/A A –> Listet Dateien mit angegebenen Attributen auf (mit dem Zusatz D –> Verzeichnisse)
/B Einfaches Format
/ON O –>  Gibt die Liste sortiert aus (mit dem Zusatz N –> alphabetisch nach Namen sortiert)

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Wenn für die beiden Verzeichnisse eine Textdatei angelegt wurde vergleicht man mit folgenden Befehl die beiden Textdateien.

fc /C /L /N C:\AndereOrdner\Ordner1.txt C:\AndereOrdner\Ordner2.txt

/C Vergleicht ohne Rücksicht auf Groß-/Kleinschreibung.
/L Vergleicht Dateien als ASCII-Textdateien.
/N Zeigt bei einem ASCII-Vergleich die Zeilennummern an.

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Die Ausgabe könnte wie folgt aussehen:

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Quelle: http://www.faq-o-matic.net/2010/05/11/unterordner-vergleichen/

Viele Grüße
Helmut